Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRG4Q92954 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PRG4Q92954 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms