Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD50Q92878 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD50Q92878 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms