Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DDB2Q92466 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DDB2Q92466 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DDB2Q92466 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms