Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FOXD4L4Q8WXT5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms