Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUFY2Q8WXA3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms