Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SSMEM1Q8WWF3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms