Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNX33Q8WV41 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms