Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHX4

SPATA3, Spermatogenesis-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA3Q8NHX4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPATA3Q8NHX4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms