Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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ZNF439Q8NDP4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ZNF439Q8NDP4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ZNF439Q8NDP4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ZNF439Q8NDP4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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ZNF439Q8NDP4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ZNF439Q8NDP4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ZNF439Q8NDP4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ZNF439Q8NDP4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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ZNF439Q8NDP4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ZNF439Q8NDP4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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ZNF439Q8NDP4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZNF439Q8NDP4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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