Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PNLDC1Q8NA58 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PNLDC1Q8NA58 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms