Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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