Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CMTM1Q8IZ96 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CMTM1Q8IZ96 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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