Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC6BQ86SZ2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms