Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms