Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP50Q70EL3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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