Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BNC2Q6ZN30 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BNC2Q6ZN30 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms