Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TREML4Q6UXN2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms