Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
C16orf54Q6UWD8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms