Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATRAIDQ6UW56 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms