Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCD3Q6STE5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms