Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3HQ6NTF7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms