Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VIRMAQ69YN4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIRMAQ69YN4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms