Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GGNBP1Q5YKI7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms