Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf135Q5VTT2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms