Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BRMS1LQ5PSV4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms