Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FGD3Q5JSP0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms