Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNNI3KQ59H18 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNNI3KQ59H18 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms