Protein–RNA interactions for Protein: Q53RT3

ASPRV1, Retroviral-like aspartic protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASPRV1Q53RT3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ASPRV1Q53RT3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms