Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL22Q53GT1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL22Q53GT1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms