Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LINC00303Q3SY05 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms