Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IMPG1Q17R60 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms