Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

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Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPP1R3AQ16821 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPP1R3AQ16821 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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