Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDKN3Q16667 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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