Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDK4Q16654 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDK4Q16654 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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