Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SNAPC1Q16533 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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