Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RPE65Q16518 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RPE65Q16518 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RPE65Q16518 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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RPE65Q16518 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPE65Q16518 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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