Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA6Q16445 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA6Q16445 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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