Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC85BQ15834 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC85BQ15834 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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