Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST6Q15828 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST6Q15828 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST6Q15828 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST6Q15828 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST6Q15828 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST6Q15828 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CST6Q15828 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST6Q15828 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST6Q15828 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST6Q15828 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST6Q15828 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST6Q15828 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST6Q15828 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST6Q15828 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST6Q15828 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST6Q15828 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CST6Q15828 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CST6Q15828 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CST6Q15828 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CST6Q15828 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CST6Q15828 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CST6Q15828 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CST6Q15828 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CST6Q15828 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CST6Q15828 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CST6Q15828 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CST6Q15828 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CST6Q15828 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CST6Q15828 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CST6Q15828 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CST6Q15828 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CST6Q15828 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CST6Q15828 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CST6Q15828 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms