Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HMGN3Q15651 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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