Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRADDQ15628 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRADDQ15628 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRADDQ15628 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRADDQ15628 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRADDQ15628 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRADDQ15628 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRADDQ15628 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRADDQ15628 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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