Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRKQ15262 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
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PTPRKQ15262 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
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PTPRKQ15262 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPRKQ15262 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
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