Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PDK3Q15120 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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