Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB3GAP1Q15042 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3GAP1Q15042 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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