Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COL4A6Q14031 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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COL4A6Q14031 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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COL4A6Q14031 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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COL4A6Q14031 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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COL4A6Q14031 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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COL4A6Q14031 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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COL4A6Q14031 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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COL4A6Q14031 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COL4A6Q14031 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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