Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPSQ13938 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms