Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDX39BQ13838 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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