Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD1Q13562 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEUROD1Q13562 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
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