Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BFSP2Q13515 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BFSP2Q13515 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
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