Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TUBB3Q13509 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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